رييس‌جمهور  در جمع روسای ستادهای اجرايی انتخابات شوراها، استانداران، اعضای هيات مركزی بازرسی انتخابات و روسای هيات‌های بازرسی استان‌ها  گفت:

واگذاری امور مردم به بيش از 200 هزار انسان در سرتاسر كشور تاثير به‌سزايی در افكار عمومی جهان داشت.

رييس‌جمهور با تاكيد بر اين‌كه نبايد از كنار اين كارهای بزرگ به سادگی عبور كرد گفت: اگر اشكالات تجربه‌ اول شوراها را با موفقيت‌هايش بسنجيم، متوجه مي‌شويم كه چه كار بزرگی در كشور صورت گرفته است.
خاتمی اظهار داشت: بايد به شعور و رشد مردم رشيد ايران تبريك گفت و عيب‌ها و نقص‌های شوراها در برخی نقاط را به كل كشور تعميم نداد.

رئيس‌جمهور گفت: بايد شرايطی فراهم شود تا همه‌ كسانی كه به لحاظ قانونی حق نامزدشدن و مشاركت كردن در انتخابات را دارند بدون دغدغه در صحنه حاضر شوند.
خاتمی خاطرنشان ساخت: ما قيم مردم نيستيم و بايد با پاسداری از آرای آن‌ها اعتماد آنان را جلب و جذب كنيم؛ زيرا اگر مردم در عرصه‌های مختلف حضور نداشته باشند ما نه در جنگ و نه در صلح موفق نخواهيم بود.
وی در بخش ديگری از سخنانش با نفی «سياست‌زدگي» در عرصه‌های مختلف به‌ويژه در زمينه‌ی شوراها گفت: نامزدان شوراهای شهر و روستا بايد افرادی كاردان و مدير در امور شهری و روستايی باشند اما اين موضوع به معنای غيرسياسی شدن آن‌ها نيست.
رييس‌جمهور تصريح كرد: همه‌ مردم ما سياسی هستند و بايد منافع و مصالح را درك كنند و بشناسند. آن‌چه بد است سياست‌زدگی و بهره‌گيری از امكانات به نفع گرايش‌های خاص است.
خاتمی تاكيد كرد: تهی شدن شوراها، مجلس شورای اسلامی، بخش‌های قضايی و اجرايی و ساير حوزه‌ها از بينش سياسی فاجعه است.
رييس‌جمهور تاكيد كرد: انتظار من از همه‌ جناح‌ها و گرايش‌ها اين است كه برنامه‌ مديريت شهری و روستايی خود را ارايه كنند.
خاتمی ادامه داد: شعارها بايد به برنامه تبديل شود تا مردم روی برنامه‌ها نظر و رای دهند و حكومت نيز بايد به رشد و شعور مردم و انتخاب آن‌ها احترام بگذارد.